日本开设动漫相关专业的大学粗略统计现有25所左右，并全部为私立大学。其中主要分为两类：第一类是从人文科学的视角将动漫当做文化或者传媒现象加以研究的学科，第二类则是漫画制作专业，主要从属于美术以及影视学科。数量分布方面第二类占了大多数。

举例：

明治大学　国際日本学研究科　ポップカルチャー研究領域

京都精華大学マンガ学部マンガ学研究科

学習院大学人文科学研究科身体表象文化学専攻

京都造形芸術大学芸術学部マンガコース

神戸芸術工科大学先端芸術学部まんが表現学科

東京工芸大学芸術学部マンガ学科

专门学校方面比较著名的有动漫专业的学校例如代々木アニメーション学院就是一所以培养动漫声优见长的专门学校。