今天主要以日本东京大学bioinformatics生物信息学专业做一个介绍。后续有时间会搜罗其他帝国及东京工业大学的该专业信息公布于众。Bioinformatics 翻译成日语是バイオインフォマティクス、生物情報学,翻译成中文是生物信息学。bioinformatics生物信息学对于人类而言是个新兴的专业领域,同时宛如历史长河般的数据、信息、知识等着当下人和未来人去探索与研究。如果论专业前景,没有比bioinformatics生物信息学更加光明宽广的了。
自从1990年美国启动人类基因组计划以来,人与模式生物基因组的测序工作进展极为迅速。迄今已完成了约40多种生物的全基因组测序工作,人基因组约3x109碱基对的测序工作也接近完成。至2000年6月26日,被誉为生命“阿波罗计划”的人类基因组计划,经过美、英、日、法、德和中国科学家的艰苦努力,终于完成了工作草图,这是人类科学世上又一个里程碑式的事件。
一、bioinformatics生物信息学主要的研究内容
序列比对(Alignment)
比较两个或两个以上蛋白质分子空间结构的相似性或不相似性
蛋白质结构预测
计算机辅助基因识别
非编码区分析和DNA语言研究
二、研究bioinformatics・生物信息学需要计算机专业能力
bioinformatics・生物信息学 与biostatistics・生物统计学的不同之处在于,bioinformatics是利用计算机技能去预测基因的变化或者解析蛋白质的构造或者去解释某些染色体组的发现。
研究bioinformatics所用的操作系统是Linux 或者Macintosh。目前没有专门为bioinformatics所开发的程序设计语言,根据具体研究对象的不同分别使用Perl 、BioPerl、 Python 、BioPython。
三、日本东京大学的bioinformatics生物信息学在哪里?
日本东京大学的bioinformatics・生物信息学在理学研究科、农学研究科和情报理工研究科。因为bioinformatics是生物生命科学与信息情报科学的结合领域所以散布在不同的研究科也是可以理解的。有的教授本职是在农学研究科同时在情报理工研究科兼职,这样的安排无疑是为了学术与研究的相互促进。
顺便说,京都大学的bioinformatics・生物信息学在ウイルス・再生医科学研究所可以找到,但这里教授都是从生命科学研究科、理学研究科、医学研究科等抽调组成。
四、什么样的学生适合申请bioinformatics生物信息学呢?
其实bioinformatics生物信息学的受众面还蛮大的,首先是优选数学、统计、计算机专业专业的学生,当然还有来自农学部、理学部的学生也很受欢迎。总之是面向理工科的学生。
五、申请bioinformatics・生物信息学专业途径:
日本大学院研究生申请
日本大学日语授课修士或博士课程
六、毕业之后的前景如何?
生物情报学的发展日新月异,在中国还处于起步阶段,在全球都面临严重的人才不足。尤其在美国也是大热专业领域。日本该专业的毕业生一般会选择继续进学读完博士课程。就职的学生中很多去了医药企业,或者大数据公司,也有去银行或政府部门的。
总之通过对生物信息学的学习日本东京大学毕业生具备了对复杂原生态信息的高度处理能力,因此在数据化的当今社会各行业都有很高需求。如果本专业就职还是建议取得博士号后在大学或研究机关从事研究职位或在制药企业从事研究职位或顾问职位。
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