京都大学土木工程专业的前三年，所有课程在京都大学吉田分校(主校区)授课。第一和二年级的学生将主要学习文科和自然科学的基础知识，如基础数学、物理、力学等。京都大学土木工程的英语授课和日语授课的课程也是基本一致。专业课程在第二年的第二学期会大幅增加。因此，二、三年级的学生必须集中精力学习土木工程领域的各种专业知识。在最后一年，已经获得足够学分的学生将来到到Katsura校区，Yoshida校区或Uji校区的土木工程研究小组，在那里开始他们的学士学位论文的研究，在毕业前的2个月必须完成论文，才能在三月迎来毕业。
