申请研究生首先必须得到导师的肯许，也就是我们通常说的导师内诺制。日本大学里，导师对研究生以上学生的招生有非常大的决定权，如果事先没有得到导师接受的承诺，即使你直接向大学院招生处提出入学申请，大学院也不会根据你的情况为你指定专业或研究室。也就是说，在没有获得导师同意下，大学院不会轻易接受学生的单独申请。反过来，如果你已经得到导师的肯许，再通过导师向大学院提出入学申请的话，成功率将非常之高。
一般申请大学院的研究生需要参考的因素有很多，主要是出身校、ＧＰＡ、日语能力和研究能力几方面。出身校是申请大学院研究生的基础，比如说本三院校学生就别申请东大这样的名校了；GPA是体现学习能力的一个指标，会作为导师的一个参考因素，学习太差的要加油了；日语能力主要是通过JLPT证书来体现，肯定是等级越高越好，一般情况下工科至少需要N2，文科需要N1 ;研究能力主要是通过研究计划书和研究成果来体现，研究计划书写的越好，对于申请的帮助越大，如果大学期间有研究成果，对于申请的帮助也是很明显的。
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