与国内的硕士课程相同，大学以上毕业后，再修两年的课程后，即为“修士课程”。若提出修士论文，并通过审查、囗试后，即可取得修士学位。
课程二：博士课程
博士课程五年一贯制“即前期二年，后期三年”。入学资格与修士课程完全一样，如东京大学经济学研究科即无修士课程，为博士课程五年制。修习两年课程后，即称为“博士课程前期”。
博士课程后期：修士学位或博士前期课程修完以后，再研修习三年课程之后，即为“博士课程后期”，而获准提出博士论文，并经审查、囗试通过后，即取得博士学位。
课程三：研究生
此制度是日本特有的现象，异于正规生，不得修取学分，仅作特定主题的研究。因大学的不同，其资格限制也不尽相同。
入学资格从五专、三专毕业到大学毕业、修士、博士课程毕业者，皆有资格申请。欲进入大学院成为正式课程生之前，大多数大学院均规定必须先以“研究生”身分申请入学。
申请“研究生”入学，不必经过考试手续，只需提出所规定的证件，得到欲进入的讲座“研究室”教授许可后，再经教授会议通过后，即可获得“入学许可书”办理入学。具备此身分的学生可取得“留学生”的在留资格。
课程四：听讲生、履修生
以非正规生的身份参加正规生课程的讲义，此等学生不能获取学位。听讲生不得修取学分、科目等。履修生可修学分，两者的入学资格、选考方式均同留学生正规生招生方式，但为取得“留学”在留资格，每周需听讲十小时以上。
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