东京大学药学研究科硕士课程只有一个专业-【药科学专业】,下面又分为：有机药科学、物理药科学以及生物药科学3个讲座。
每个讲座具体包含的课程有:
有机药科学讲座：药物化学，天然物合成化学，有机合成化学，天然物化学，基础有机化学
物理药科学讲座：生物分析化学, 生命物理化学
生物药科学讲座：卫生化学、生理化学、分子生物学、遗传学、细胞信息学、蛋白质代谢学
